Длительная военная служба и непосредственное участие в военных действиях определили область научных интересов Г. – военная история России и Европы. Наиболее значимым трудов является опубликованный в 1893-1896 гг. «Краткий курс истории военного искусства». В трех томах этого исследование рассказывается о военном деле средневековой Европы, XVII- начала XVIII вв., а последний том посвящен времени Фридриха Великого и Екатерины Великой. Также в своих работах Г. затрагивал сюжеты, связанные с военными действиями на территории Турции в 1870х гг., непосредственными участниками которых он был.
Палеонтолог. Признан одним из ведущих специалистов в области палеоэкологии. Создатель первой в нашей стране лаборатории палеоэкологии морских фаун. В честь ученого названо более 20 различных ископаемых животных.
Палеонтолог, активно участвовала в исследованиях своего супруга, Р.Ф. Геккера, ведущего специалиста в области палеоэкологии.
Специалист по древностям Крыма.
Г. – специалист в области античной филологии и искусства. Свою магистерскую диссертацию посвятил творчеству известного драматурга Тита Макция Плавта. Г. прежде всего анализировал не содержание его произведений, а их лексические особенности. В качестве приложения к данному труду помещен словарь прилагательных, использованных в основных произведения Плавта.
Специалист по вопросам общей физики.
Г. – крупный ученый-охотовед, автор справочных и методических пособий.
Научная деятельность А.Г. Генкеля осуществлялась в области биологии низших организмов, фитопланктона и морфологии покрытосеменных растений. Г. Изучал фитопланктон Каспийского и Карского морей, открыл отрицательный металлотропизм у мукорового гриба, проводил наблюдения по распределению цитоплазмы при фототропизме мукоровых. В своих работах Г. предстает как дарвинист и материалист.
Специалист по истории и этнографии народов Северного и Южного Кавказа. Собранные в ходе экспедиций материалы позволили Г. создать ряд грамматик и словарей для бесписьменных народов Кавказа. Особенно известными стали его исследования таких народов, как убыхи, цахуры, хиналугцы, абазины.
Г. – специалист по истории церкви, древним языкам. В рамках университетского преподавания читал курс, посвященный Апостолу Павлу. Уже находясь в эмиграции, Г. обращается прежде всего к общественно-политической публицистике, опубликовав в зарубежных изданиях, целый ряд статей о т.н. теории «солидаризма».