В центре научных интересов И. находились вопросы положения русского крестьянства XIX в., политики царского правительства в отношении крестьянства, восстания и волнения в деревнях в этот период. Придерживаясь революционных взглядов, И. в своих трудах выступала с резкой критикой правительственной политики в отношении крестьянства. В частности, она указывала на закономерность и справедливость требований восстававших крестьян и на антинародный характер реформы 1861 г.
Переломные события истории России: 1917 год в истории России; история социалистических партий России в 1917 г.; Великая Отечественная война 1941–1945 гг.; Вторая мировая война 1939–1945 гг.; история обороны Ленинграда в годы Великой Отечественной войны.
В сферу научных интересов И. входили лексикология и морфология славянских стран, древняя история славянских языков, палеография. Он заложил основы современных знаний о праславянском языке. Изучал и издавал старославянские, сербские и болгарские памятники. Под руководством А.А. Шахматова И. работал над созданием "Словаря русского языка", составляя историко-этимологический комментарий к словам. Особое значение имеют этимологические исследования И., которые внесли существенный вклад в изучение таких вопросов, как праславянский язык, территория славянской прародины, история географических названий.
Книговедение, история литературы.
Исследования в области геологии (в т. ч. Севера Европейской России, Кавказа), минералогии, палеонтологии и археологии; занимался изучением метаморфизма, стратиграфии, гидрогеологии, палеонтологии;. Под его руководством была разработана геохронологическая шкала, принятая на Международном конгрессе. основатель университетской школы геологии, имел много учеников. В 1870-1880-е гг. много интересовался вопросом о первобытном человеке, дал описание стоянки каменного века на берегу Ладожского озера (1882)
Выдающийся советский музыковед и искусствовед. Основные труды И. посвящены истории музыкально-драматического искусства, оперного искусства. Наибольшее значение имеет мультидисциплинарный подход И. к изучению искусства в целом, реализованный в его докторской диссертации. Автор работ о музыкальном искусстве XVI-XVIII вв., а также о музыке советского кино. Значительное место в трудах И. занимают проблемы связи музыки с другими видами искусств
Политическая история России XX века, архивоведение, археография, источниковедение. Специалист по истории Октябрьской революции, а также жизни и политической деятельности В.И. Ленина. Благодаря усилиям И. издано собрание сочинений В.Н. Татищева.
И. являлся специалистом в области истории русского искусства ХVIII-XIX вв. и, прежде всего, творчества Ф. Шубина, М.И. Козловского и В.И. Демут-Малиновского. Велик вклад И. в развитие музейного дела в СССР, организацию преподавания истории искусства. Достаточно широко известны скульптурные работы самого И.
Богатое научное наследие И. состоит более чем из сотни работ. Основными объектами исследования для И. стали история литературы и проблемы древнерусского языка. Большое внимание И. уделяет изучению древнейшей русской литературы. При этом исследователь признавал переводную литературу неотъемлемой частью древнерусской письменности, а потому считал необходимым подробное изучение славянских переводов византийских хроник, которые в большей части к концу XIX в. не были опубликованы и исследованы. В связи с этим большое место в его творчестве занимает трехтомная монография «Книги временныя и образныя Георгия Мниха. Хроника Георгия Амартола в древнем славяно-русском переводе. Текст, исследование и словарь» (1920-1930). И. интересовали оригинальные и компилятивные памятники древнерусской литературы. Его работы посвящены Даниилу Заточнику и изучению Толковой Палеи. Один из ключевых вопросов научных занятий И. – вопрос о критериях национальной принадлежности тех или иных славянских переводов. Помимо изучения древнерусской литературы занимался исследованием творчества русских писателей XIX в., в том числе Пушкина. Ему принадлежат исследования по изучения жизни и творчества А. С. Кайсарова...