Н. родился в семье священника. После окончания духовной школы поступил на историко-филологический факультет Петербургского университета, выпускником которого стал в 1884 г.
С декабря 1884 г. – учитель всеобщей истории, русского языка и словесности Ришельевской гимназии в Одессе. С 1887 г. перешел в Таганрогскую гимназию, где преподавал те же предметы, а также был классным наставником. В 1889 г. параллельные классы гимназии были упразднены, а Н. уволен. Вскоре он переехал в Петербург. С 1892 г. – слушатель Петербургского археологического института, а также канцелярский чиновник синодальной канцелярии, откомандированный для занятий в архив Святейшего Синода. В 1894 г. он окончил Археологический институт, а в 1896 г. получил должность помощника архивариуса архива Св. Синода. В октябре 1901 г. избран членом Высочайше учрежденной комиссии по описанию Синодального архива. С 1903 г. и до своей смерти – архивариус архива и библиотеки Святейшего Синода. Неоднократно исполнял обязанности начальника архива и библиотеки. В 1908 г. изучал в Новгородских монастырях рукописи и книги, которые следует передать в архив и библиотеку Св. Синода.
С 1903 г. – член Новгородской губернской ученой архивной комиссии.
С 1906 г. – действительный член Новгородского губернского статистического комитета.
С 1908 г. – член-корреспондент Императорского общества любителей древней письменности.
С 1912 г. – член совета Санкт-Петербургской губернской ученой архивной комиссии.
С 1913 г. – действительный член Новгородского церковно-археологического общества.
Умер 14 апреля 1914 г. по пути на работу от сердечного приступа.
Историк, архивист. Специалист по церковным древностям Новгородской и Псковской земли. Автор ряда научных публикаций, а также статей «Нового энциклопедического словаря» Брокгауза и Ефрона и более ста биография для «Русского биографического словаря».
Методика истории по Кригеру / Сост. И. Виноградов и А. Никольский. М.: изд. тип. А.А. Карцева, 1885. 176 с.
Никольский А.И. Новгородский большой пожар церквей в 1745 году. СПб.: тип. А.П. Лопухина, 1902. 20 с.
Никольский А.И. Описание рукописей, хранящихся в Архиве Святейшего правительствующего синода. СПб.: Синод. тип., 1904-1910. 3 т.
Никольский А.И. Сказание об обретении честных мощей святителя Никиты новгородского чудотворца. СПб.: тип. Акад. наук, 1905. 17 с.
Никольский А.И. Беглые заметки по церковной археологии города Новгорода. СПб.: тип. П.П. Сойкина, 1905. 14 с.
Никольский А.И. Катихизис Арсения Мацеевича. СПб.: тип. Имп. Акад. наук, 1907. 16 с.
Никольский А.И. Сказание о двух новгородских чудесах из жития святого Иоанна Предтечи и крестителя господня. СПб.: тип. Имп. Акад. наук, 1907. 19 с.
Никольский А.И. Несколько слов о житии и сочинениях святого Димитрия Ростовского. СПб.: тип. Имп. Акад. наук, 1909. 12 с.
Никольский А.И. Заметки о прошлом упраздненных монастырей Новгородской епархии. Новгород: [б. и.], 1908 -. Ч. 2. 1911. 10 с.
Никольский А.И. Реставрация икон и настенной иконописи в Московских соборах: Большом Успенском, Архангельском и Благовещенском в 1770-1773 годах. СПб.: Синод. тип., 1913. 12 с.
Никольский А.И. Синодальный надзор в области иконописания в XVIII веке. СПб.: Синод. тип., 1913. 14 с.
Христианство: Энциклопедический словарь. М.: Науч. изд-во "Большая российская энциклопедия", 1995. Т.2. С.213.
А.И. Никольский: [Некролог] // Церковные Ведомости. 1914. №16. С.773-774.
Никольский, А.И.: [Некролог] // Исторический Вестник. 1914. Т.136. С.766.
А.И. Никольский (Некролог) // Вечернее время. 1914. 15 апр. № 738. С.3.
ЦГИА СПб. Ф.14. Оп.3. Д.20204. Никольский Антон Иванович. 14.08.1878
В.В. Андреева, Е.А. Ростовцев
Петербургская историческая школа (XVIII – начало XX вв.): информационный ресурс. СПб., 2016-.
Ред. коллегия: Т.Н. Жуковская, А.Ю. Дворниченко (руковод. проекта, отв. ред.), Е.А. Ростовцев (отв. ред.), И.Л. Тихонов
Авторский коллектив: Д.А. Баринов, А.Ю. Дворниченко,Т.Н. Жуковская, И.П. Потехина, Е.А.Ростовцев, И.В. Сидорчук, Д.А. Сосницкий, И.Л. Тихонов и др.