1883 г. – почетный член Императорского Ботанического сада.
1899 г. – лауреат Большой золотой медали им. П.П. Семенова Императорского Русского географического общества.
1862-1865 гг. – врач при русском посольстве в Тегеране.
1866-1884 гг. – врач при русском посольстве в Пекине.
Ботаник, китаевед, географ, медик. В центре исторических изысканий Б. было изучение китайской научной традиции XIII-XVII вв., сведений о ней в западных источниках.
Mediaeval Researches from Eastern Asiatic Sources: Fragments towards the Knowledge of the Geography and History of Central and Western Asia from the 13th to the 17th Century (Vol. 1–2. London, 1888).
Botanicon Sinicum: Notes on Chinese Botany from Native and Western Sources (P. I. Ibid. 1881. Vol. 16. P. 18–230; P. II. Ibid. 1892. Vol. 25. P. 1–468; P. III. Ibid. 1895. Vol. 29. P. 1–623).
History of European Botanical Discoveries in China (Vol. 1–2. London, 1898).
Очерк путешествия в Сы-Чуань и на восточную окраину Тибета в 1892-1893 г. СПб.: тип. В. Безобразова и К°, 1899.
Карта Китайской империи. СПб.: Картографическое заведение А. Ильина, 1900.
Липшиц С.Ю. Бретшнейдер, Эмилий Васильевич // Русские ботаники. Биографо-библиографический словарь / Отв. ред. В. Н. Сукачёв. — М.: Изд-во МОИП, 1947. Т. I. А-Б. С. 272–273.
Бретшнейдер Эмилий Васильевич // Энциклопедический словарь «Гранат». Т. 6. С. 544.
ЦГИА СПб. Ф. 1289. Оп. 1. Ед. хр. 201. Акционерное общество "Картографическое заведение А.Ильина" (Петроград): 1859-1918. Дело Э.В. Бретшнейдер.
ЦГА СПб. Ф. Р-7160. Оп. 1. Д. 1455. Копии документов из архива востоковедов СПб филиала Института востоковедения РАН (ф.8, ед. хр.62). Письма Попова Н.А. Э.В. Бретшнейдеру о путешествии в Китай 1885-1890 г. (Фучжоу).
Петербургская историческая школа (XVIII – начало XX вв.): информационный ресурс. СПб., 2016-.
Ред. коллегия: Т.Н. Жуковская, А.Ю. Дворниченко (руковод. проекта, отв. ред.), Е.А. Ростовцев (отв. ред.), И.Л. Тихонов
Авторский коллектив: Д.А. Баринов, А.Ю. Дворниченко,Т.Н. Жуковская, И.П. Потехина, Е.А.Ростовцев, И.В. Сидорчук, Д.А. Сосницкий, И.Л. Тихонов и др.