И. являлся признанным специалистом в синологии. В центре его внимания находились вопросы истории Китая, его литературы, философии, этнографии, археологии. В соавторстве с Е.Д. Поливановым опубликовал грамматику китайского языка. Первым среди отечественных ученых стал изучать историю и культуру тангутов. Также являлся специалистов в области японской филологии.
И. внес существенный вклад в преподавание истории и географии в гимназиях дореволюционной России, являлся автором и инициаторов введения новых педагогических методов и приемов. Учебники И. по отечественной и зарубежной истории выдержали десятки переизданий. Также являлся автором перевода трагедии Гете «Фауст» (издана после его смерти).
История французской революции. Деятельность Генриха Ибсена. История образования. История женского движения.
Сфера научных интересов И. – тибетология, история Китая. И. также занимался публикацией исследований положения инородцев в Китае, переводом источников с тибетского и китайского на русский язык. В 1890-х гг. под руководством И. была издана хрестоматия с образцами маньчжурского языка.
В центре научных интересов И. находились вопросы политической экономии и истории экономики. Являлся одним из ведущих теоретиков-экономистов дореволюционной России. Ряд исследований посвящен наследию таких британских экономистов, как Г. Маклеод и А. Смит. Занимался исследованием истории экономического быта европейцев, истории социализма, истории отмены крепостного права в России.
Нумизматика. В годы педагогической деятельности участвовал в работе Минцкабинета Императорского Эрмитажа, в частности в составлении рукописного каталога монет Прибалтики. В 1872, к 200-летию Петра I, опубликовал сочинение «Медали на деяние императора Петра Великого», удостоенное большой серебряной медали ИРАО (1873) и Высочайшей благодарности; в 1874 вышел «Словарь медальеров». Его исследование «Медали в честь русских государственных деятелей и частных лиц» было отмечено большой золотой медалью ИРАО (1884). С его именем связана наиболее серьёзная работа с собранием русских медалей Эрмитажа. В своих трудах И. внимательно относился к полному подбору вариантов одного и того же вида медалей; использовал материалы архива Петербургского Монетного двора, утраченные во время первой мировой войны; опубликовал и ввел в научный оборот множество ранее неизвестных памятников. Коллекцию монет и медалей (более 3000 экз.) и библиотеку Иверсена после его смерти приобрел Эрмитаж. Опубликовал ряд статей по разным вопросам археологии и преимущественно о медалях в «Berliner Blätter», в «Известиях Имп. Русского Археологич. Общества», в «Трудах» археологических съездов.
В сферу научных интересов И. входили лексикология и морфология славянских стран, древняя история славянских языков, палеография. Он заложил основы современных знаний о праславянском языке. Изучал и издавал старославянские, сербские и болгарские памятники. Под руководством А.А. Шахматова И. работал над созданием "Словаря русского языка", составляя историко-этимологический комментарий к словам. Особое значение имеют этимологические исследования И., которые внесли существенный вклад в изучение таких вопросов, как праславянский язык, территория славянской прародины, история географических названий.
Книговедение, история литературы.